Các vụ án ám ảnh nhất trong Conan thường nổi bật với yếu tố kinh dị, tâm lý nặng nề và những tình tiết bạo lực bất ngờ, tiêu biểu như
Vụ Án Người Đàn Ông Quấn Khăn Trắng (ám ảnh bởi sự truy sát không ngừng nghỉ), Vụ Án Biệt Thự Nhện Tottori (lời nguyền kỳ quái và cái chết liên hoàn), Vụ Án Bi Kịch Người Phụ Nữ Áo Đỏ (yếu tố siêu nhiên và cái kết đau lòng), Vụ Án Lâu Đài Xanh Cổ (bầu không khí ma mị) và Vụ Án Sát Nhân Dưới Lớp Băng Cuốn (mức độ bạo lực cao nhất series).
Các vụ án kinh điển gây ám ảnh (trong manga/anime):
Các vụ án lớn trong phim điện ảnh (Movie):
Vụ Án Người Đàn Ông Quấn Khăn Trắng (ám ảnh bởi sự truy sát không ngừng nghỉ), Vụ Án Biệt Thự Nhện Tottori (lời nguyền kỳ quái và cái chết liên hoàn), Vụ Án Bi Kịch Người Phụ Nữ Áo Đỏ (yếu tố siêu nhiên và cái kết đau lòng), Vụ Án Lâu Đài Xanh Cổ (bầu không khí ma mị) và Vụ Án Sát Nhân Dưới Lớp Băng Cuốn (mức độ bạo lực cao nhất series).
Các vụ án kinh điển gây ám ảnh (trong manga/anime):
- Người Đàn Ông Quấn Khăn Trắng (Mountain Villa Bandaged Man Murder Case) (Tập 34-35): Vụ án kinh điển với kẻ sát nhân quấn băng, dùng rìu truy sát tàn độc, ám ảnh người xem bởi sự bạo lực và diễn biến căng thẳng, đặc biệt khi Ran trở thành mục tiêu.
- Vụ Án Biệt Thự Nhện Tottori (Tottori Spider Mansion Demon) (Tập 25-26): Bí ẩn xoay quanh lời nguyền gia tộc và những cái chết kỳ lạ liên quan đến nhện, tạo không khí rùng rợn, bí hiểm.
- Bi Kịch Người Phụ Nữ Áo Đỏ (The Tragedy of the Red Woman)(Tập 82-83): Yếu tố siêu nhiên, người phụ nữ áo đỏ bí ẩn và những án mạng liên tiếp, kết thúc đầy bi kịch và ám ảnh.
- Lâu Đài Xanh Cổ (The Old Blue Castle Investigation) (Tập 3-4): Vụ án ma ám với bầu không khí u ám, kinh dị ngay từ những tập đầu tiên của Conan.
- Sát Nhân Dưới Lớp Băng Cuốn (Mountain Villa Bandaged Man Murder Case) (Tập 5): Được đánh giá là một trong những vụ án rùng rợn và bạo lực nhất, khi nạn nhân bị băng cuốn che phủ khuôn mặt và hành động tàn bạo.
- Vụ Án Dinh Thự Quỷ Ám (A Haunted Mansion Murder): Vụ án đầu tiên nhóm thám tử nhí đối mặt, tạo ấn tượng mạnh bởi sự kỳ quái ngay từ đầu.
Các vụ án lớn trong phim điện ảnh (Movie):
- Cơn Ác Mộng Đen Tối (The Darkest Nightmare): Liên quan đến Tổ chức Áo Đen, gây căng thẳng tột độ khi thân phận của Conan/Shinichi có nguy cơ bị lộ.
- Kẻ Hành Pháp Zero (Zero the Enforcer): Xoay quanh Tổ chức Áo Đen và đặc vụ Amuro Tooru (Bourbon), đầy kịch tính và hành động, mang tính nhân văn sâu sắc.
- Bản Tình Ca Màu Đỏ Thẫm (The Crimson Love Letter): Vụ án phức tạp liên quan đến Heiji và Kazuha, mang đậm yếu tố văn hóa Nhật Bản và những bí ẩn tình cảm.