Nguyên nhân gây viêm amidan chủ yếu là do nhiễm trùng từ virus (như cúm, adenovirus) và vi khuẩn (phổ biến nhất là liên cầu tan huyết nhóm A). Các yếu tố khác tạo điều kiện thuận lợi bao gồm thời tiết thay đổi đột ngột, môi trường ô nhiễm, vệ sinh cá nhân và răng miệng kém, hoặc lối sống không lành mạnh (hút thuốc, uống rượu bia, ăn đồ lạnh).